评价菊花抗病种质资源的目的是利用这些种质资源进行菊花抗病育种工作。本研究根据研究人员1986年的报道，将菊花对抗性分为完全免疫（R）、不完全抗性（IR）、枯斑型（N）和感病型（S）4种类型，其中完全免疫类型受一个显性基因控制，抗性稳定，不完全抗性类型，推测涉及几个基因，此种类型的抗性只是延缓了孢子的产生，并不能完全阻止。而枯斑型抗性利用价值**，这种对入侵病原的过敏性反应通常太慢，而不能完全阻止孢子的产生。因此在进行菊花抗白锈病育种时可以利用完全抗性类型的品种，并且保存不完全抗性品种。本研究筛选出9个完全免疫品种和18个不完全抗性品种可以用于抗性育种研究。此外，对于本研究筛选出的菊花抗病品种，可以考虑以下利用方式：菊花苗批发基地

1、直接改型栽培：对于观赏性状好、具有市场开发潜力的品种可以直接利用抗病性，通过进一步的生产稳定性和栽培技术研究或稍加改良便可作为切花菊进行生产推广。

2、作为杂交育种的亲本：菊花是天然异花授粉植物，这是菊花品种繁多、类型丰富的主要原因。杂交育种目前是菊花育种的常规途径之一。对于本研究中筛选出的菊花抗病种质资源，可以综合考虑其观赏性状、生长发育特性等作为菊花抗病育种的杂交亲本，将其与市场上不抗病的主流品种杂交，实现抗病性状向生产中具有市场价值的感病品种转移。

3、为菊花抗病分子育种提供抗病基因资源：随着分子生物学技术的发展，转基因技术为菊花育种提供了一条新的途径，目前该技术已经在菊花的花色、花期、花型、株型和抗病虫育种等方面取得了一定的进展。